dnaman是一款由Lynnon Biosoft公司研發(fā)的綜合性分子生物學(xué)序列分析程序。是一款高度一體化的應(yīng)用軟件，能夠完成絕大多數(shù)常規(guī)的核酸與蛋白質(zhì)序列分析任務(wù)，包括多重序列比對、PCR引物設(shè)計(jì)、限制性酶切圖譜分析、蛋白質(zhì)參數(shù)計(jì)算以及質(zhì)粒圖譜繪制等功能。依靠其快速的運(yùn)算效率、豐富的功能配置、可靠的分析準(zhǔn)確性以及穩(wěn)定的輸出質(zhì)量，已是分子生物學(xué)研究者所信賴的基礎(chǔ)軟件之一。趕快下載使用吧!

dnaman使用教程

1、打開在本站下載好的DNAMAN軟件，打開軟件后，點(diǎn)擊軟件頂部的點(diǎn)擊File，在彈出的選擇中選擇new

2、在新建好的對話框中輸入DNA序列

3、輸入完后，同時(shí)按住鍵盤上Ctrl和A，選中序列，并單擊軟件頂部“seq”圖中以為大家標(biāo)注出來。

4、然后點(diǎn)擊軟件頂部的Sequence選項(xiàng)，在彈出的選項(xiàng)中點(diǎn)擊Display，在二級菜單中點(diǎn)擊Rev.Compl.Sequence

5、然后就可以得到原序列的反向互補(bǔ)序列。

dnaman軟件特色

1.DNA和蛋白質(zhì)序列編輯

2.DNA序列轉(zhuǎn)化

3.多序列比對、對齊編輯和分析

4.系統(tǒng)樹分析

5.DNA或蛋白質(zhì)序列的點(diǎn)陣比較

6.DNA序列組裝和編輯

7.支持通過網(wǎng)絡(luò)界面在Intranet/Internet Server上進(jìn)行BLAST搜索

8.序列和數(shù)據(jù)庫中的增強(qiáng)型圖案搜索

9.SiRNA選擇器

10.限制分析

11..繪制序列圖(支持出版品質(zhì))

12.限制模式預(yù)測

13.電子克隆

14.從限制片段重建限制圖

15.靜音突變分析(創(chuàng)建/破壞限制性位點(diǎn))

16.導(dǎo)向不匹配以創(chuàng)建/破壞限制站點(diǎn)

17.翻譯和密碼子使用分析

18.蛋白質(zhì)疏水性/親水性分析

19.蛋白質(zhì)表征：序列組成和等電點(diǎn)預(yù)測

20.蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測

21.反向翻譯

22.PCR和測序引物的設(shè)計(jì)

23.表征DNA或引物序列的熱力學(xué)性質(zhì)

24.分歧分析

25.管理寡核苷酸、DNA和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫

26.生成隨機(jī)序列

dnaman軟件功能

1.數(shù)據(jù)庫管理：選擇“數(shù)據(jù)庫|經(jīng)理”命令，即可打開“數(shù)據(jù)庫管理器”對話框，便捷管理各類序列數(shù)據(jù)庫;

2.DNA和蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫：具備完善的數(shù)據(jù)庫功能，允許按不同科目分類組織DNA和蛋白質(zhì)序列;

3.編輯記錄信息：支持編輯特定記錄的相關(guān)信息，序列列表框中的所有記錄可按字母順序或記錄順序排列，每條記錄名稱旁會顯示由DNAMAN自動分配的記錄號(ID)，因此可對不同記錄使用相同名稱;

4.掃描序列的相似性：可掃描默認(rèn)數(shù)據(jù)庫中的所有序列記錄，搜索當(dāng)前序列的同源序列。需注意，若默認(rèn)數(shù)據(jù)庫包含DNA序列，當(dāng)前序列需為DNA序列;若默認(rèn)數(shù)據(jù)庫包含蛋白質(zhì)序列，當(dāng)前序列需為蛋白質(zhì)序列。軟件將采用快速對準(zhǔn)方法掃描數(shù)據(jù)庫序列相似性，可選擇對結(jié)果最終輸出采用快速對齊或最佳對齊方式;

5.錯(cuò)配分析：旨在找到引物與默認(rèn)DNA序列中所有可能的退火位點(diǎn)，適用于PCR和DNA測序的引物選擇。通過權(quán)重矩陣區(qū)分引物不同位置的重要性，由于引物3’末端與目標(biāo)DNA的匹配對PCR擴(kuò)增比5’末端更關(guān)鍵，因此3’末端被賦予更高權(quán)重。為提升PCR引物特異性，應(yīng)通過此功能檢查引物與靶DNA之間是否存在次級退火位點(diǎn)。